תקציב משרד הבינוי והשיכון בתוכנית הוא 150 מיליון ₪ לשנים 2009–2011, 50 מיליון לשנה, כך שכל יישוב יקבל 5 מיליון ₪ בשנה.
לתקציבים אלה יתווספו תקציבים ממשרדים אחרים.
התוכנית כוללת איגום משאבים ממשרדי ממשלה נוספים ומגופים חוץ-ממשלתיים, כמו, משרד האוצר, המשרד לפיתוח הנגב והגליל, משרד התיירות, קק"ל ורשויות מקומיות. בכוונת משרד הבינוי והשיכון לרתום משרדי ממשלה נוספים, כך שכל משרד יוכל להשקיע את תשומותיו ביישובים, ובכך להשלים את הפעולות האחרות הנדרשות לחיזוקם.
על פי סיכום שבין משרד הבינוי והשיכון לבין משרד האוצר, תישקל הארכת התוכנית בשלוש שנים בתום שלב א של התוכנית ולאחר הערכתה.
